会计电算化创新了传统的会计理论和实务，改变了会计组织结构和业务程序，传统的审计手段滞后于电算化的会计要求，手工审计已不能适应现代电算化会计，因此，开展电算化审计势在必行。
一、实施电算化审计的必要性
电算化会计是会计发展的必然趋势，由于电算化会计与手工会计无论在会计基础，还是在会计工作方法等方面都存在着很大差别，因此，传统的财务审计在新的条件下就显得很不适应，必须进行改变、补充和完善。会计电算化对审计的影响，大体表现在以下几个方面：
1、审计人员变化的需要。实现会计电算化后，由于会计电算化信息系统的环境比手工会计系统更为复杂，审计对象也更多元，审计人员只依靠原有的知识和技能，无法胜任会计电算化信息系统的审计。
2、审计内容变化的需要。在会计电算化的条件下，审计的经济监督职能并没有改变，但由于电算化的特点，审计的内容要发生相应的变化。在会计电算化信息系统中，由于会计事项由电算化按程序自动进行处理，诸如手工会计系统中因疏忽大意而引起的计算或过账错误的机会大大减少。但如果会计电算化系统的应用程序出错或被人为非法篡改，则电算化只会按给定的程序以同样错误的方式处理有关的会计事项，错误的结果将不堪设想。会计电算化系统也可能被神不知鬼不觉地嵌入非法的舞弊程序，不法分子可以利用这些舞弊程序大量吞没企业的财物。
3、审计技术变化的需要。实现会计电算化以后，会计电算化信息系统与传统手工会计系统相比，在许多方面发生变化，必须采用新的审计技术方法才能适应这种变化。例如，传统的记账方法是每登记一笔账，便可以从账上看到相应一笔记录，而电子电算化却不能每登记一笔记录就打印一笔记录，供工作人员阅读，一般是经过一个阶段，于一个月或一日打印一次。平时，记录输入到电算化以后，在尚未打印以前，若想看这些记录，只能凭借机器阅读，倘若想同时在几笔记录中对照查看，则很难做到。又如，传统的手工记账一般可以从字迹上辨认出登记人，从而明确责任，但是电算化只能提供统一模式的输出资料，没有记录人的笔迹，无法从记录上辨认登记人，这可以使在电算化的记录中建立、更新、消除一切资料而不留半点痕迹。
４、审计标准和准则变化的影响。审计界已建立了一系列的审计标准和准则，如审计人员标准、现场作业标准、审计报告标准、职业道德规范等等。实现会计电算化以后，由于审计对象和审计线索发生了重大变化，审计的技术和手段也相应地发生了变化，审计标准和准则也发生了相应的变化，对电算化会计的审计也提出了新的要求。
5、审计线索变化的需要。实施了会计电算化，审计线索会发生很大的变化，传统的审计线索在电算化系统中中断甚至消失。在手工会计系统中，从原始凭证到记账凭证，由过账到财务报表的编制，每一步都有文字记录，都有经手人签字，审计线索十分清楚。审计人员进行审计时，可以根据需要进行顺查、逆查或抽查。但在会计电算化系统中，传统的账簿没有了，绝大部分的文字记录消失了，由存储会计信息的磁盘和磁带取而代之，因此，肉眼所见的线索减少。此外，从原始数据进入电算化，到财务报表的输出，这中间的全部会计处理集中由电算化按程序指令自动完成，传统的审计线索在这里中断甚至消失。传统的查账方法，对电算化的会计主体已不完全适用。
6、审计作业手段变化的需要。在手工会计系统的情况下，审计人员进行审计，一般都是手工操作。但是，在会计电算化信息系统的情况下，审计人员如果仍用手工操作的方式来进行审计，是很难达到其审计目标的。
二、如何加强会计电算化的审计
由于我国大部分审计人员对电算化会计系统并不太熟悉，也没有一套完整的电算化审计准则，大部分地区的审计工作仍停留在手工审计阶段，这种现状妨碍了我国会计电算化事业的健康发展，应从以下方面提高电算化审计的质量：
1、增加审计审核窗口。会计电算化系统的核心就是会计软件，会计软件程序质量的高低，直接决定了会计电算化系统整体水平的高低，审计的重点是会计软件程序对数据进行处理和控制的及时性、正确性和可靠性，以及程序的纠错能力和容错能力，应增加审计审核窗口，可采用通过计算机审计的方法及利用计算机辅助审计中的数据转换功能的方法来完成。同时，为了能够有效地审计电算化的会计主体，在电算化会计系统的设计和开发时，必须注意审计的要求，使系统在处理时留下新的审计线索，以便审计人员在电算化条件下也能跟踪审计线索，顺利完成审计任务。
2、提倡事前系统审计。在会计电算化条件下，审计人员要花费较多的时间和精力来了解和审查电算化系统的功能，以证实其处理的合法性、正确性、完整性和安全性。另外，当一个会计电算化系统已经完成并投入使用后，要对它进行改进，这比在系统设计和开发阶段进行困难得多，代价也要昂贵得多，系统的处理是否合法合规，是否安全可靠，都与电算化系统的处理和控制功能有关，这是在传统的手工审计中所没有的。除了要对投入使用后的电算化会计信息系统审计外，应提倡在电算化系统的设计和开发阶段，审计人员要对系统进行事前和事中审计。
3、改变审查取证方法。随着电算化会计的应用和发展，对证据进行检验和审核的方法也必须相应的改变，这就需要：一是审计人员对会计电算化部门的内部管理制度、职责的划分情况进行审查和评价。二是审计人员的作业手段也应由手工操作向电子电算化转变，即审计人员应掌握电子电算化知识及其应用技术，把电子电算化当作一种提高审计质量和效率的有力工具来使用。
4、提高审计人员素质。审计人员除了要具有丰富的财务会计、审计等方面的知识和技能，还需要熟悉有关的政策、法令依据以及其它的审计依据外，还应掌握一定的电子电算化知识和应用技术。此外，建议在审计组织中培养一批电算化审计的系统开发人员，从事设计和开发审计应用软件的工作，建立自己的电算化审计系统。
5、更新审计标准准则。为适应新形势发展的需要，应在原有的审计标准和准则的基础上，建立一系列与新情况相适应的新的审计标准和准则，如电算化审计人员培训会计电算化信息系统开发的审计准则、内部控制审计准则、审计应用软件标准等。